Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIMPOLQ96LW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
PRIMPOLQ96LW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIMPOLQ96LW4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms