Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARK4Q96L34 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARK4Q96L34 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK4Q96L34 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK4Q96L34 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK4Q96L34 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK4Q96L34 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARK4Q96L34 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK4Q96L34 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK4Q96L34 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK4Q96L34 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK4Q96L34 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK4Q96L34 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK4Q96L34 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK4Q96L34 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms