Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJD4Q96KN9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJD4Q96KN9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms