Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLPTM1LQ96KA5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPTM1LQ96KA5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1LQ96KA5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms