Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
JPH4Q96JJ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
JPH4Q96JJ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
JPH4Q96JJ6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
JPH4Q96JJ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
JPH4Q96JJ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms