Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK5RAP3Q96JB5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK5RAP3Q96JB5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms