Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY4

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16Q96EY4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMA16Q96EY4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMA16Q96EY4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMA16Q96EY4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms