Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDL1Q96EA4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms