Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM44Q96DX7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM44Q96DX7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms