Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERP27Q96DN0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP27Q96DN0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms