Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TIFAQ96CG3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIFAQ96CG3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIFAQ96CG3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms