Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX1

VPS33A, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33AQ96AX1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS33AQ96AX1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS33AQ96AX1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS33AQ96AX1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms