Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTSSAQ969W0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms