Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF34Q969K3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms