Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCE1Q969G3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCE1Q969G3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms