Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C6Q969F1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C6Q969F1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms