Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP13Q92995 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP13Q92995 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP13Q92995 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP13Q92995 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP13Q92995 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP13Q92995 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP13Q92995 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP13Q92995 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP13Q92995 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP13Q92995 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP13Q92995 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP13Q92995 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP13Q92995 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP13Q92995 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP13Q92995 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP13Q92995 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP13Q92995 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP13Q92995 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP13Q92995 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP13Q92995 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP13Q92995 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP13Q92995 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP13Q92995 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP13Q92995 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP13Q92995 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP13Q92995 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP13Q92995 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP13Q92995 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP13Q92995 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP13Q92995 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP13Q92995 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP13Q92995 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP13Q92995 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP13Q92995 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP13Q92995 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP13Q92995 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP13Q92995 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP13Q92995 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP13Q92995 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP13Q92995 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP13Q92995 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP13Q92995 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP13Q92995 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP13Q92995 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP13Q92995 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP13Q92995 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP13Q92995 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP13Q92995 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP13Q92995 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP13Q92995 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP13Q92995 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP13Q92995 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP13Q92995 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP13Q92995 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP13Q92995 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP13Q92995 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP13Q92995 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP13Q92995 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP13Q92995 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP13Q92995 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP13Q92995 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP13Q92995 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP13Q92995 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP13Q92995 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP13Q92995 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP13Q92995 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP13Q92995 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP13Q92995 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP13Q92995 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP13Q92995 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP13Q92995 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP13Q92995 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP13Q92995 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP13Q92995 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP13Q92995 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP13Q92995 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP13Q92995 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP13Q92995 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP13Q92995 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP13Q92995 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP13Q92995 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP13Q92995 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP13Q92995 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP13Q92995 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP13Q92995 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP13Q92995 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP13Q92995 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP13Q92995 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP13Q92995 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP13Q92995 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP13Q92995 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP13Q92995 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP13Q92995 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP13Q92995 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP13Q92995 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP13Q92995 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP13Q92995 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP13Q92995 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP13Q92995 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms