Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCD2Q92925 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCD2Q92925 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCD2Q92925 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms