Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3BQ92485 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms