Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113Q902F9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERVK_113Q902F9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113Q902F9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113Q902F9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113Q902F9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113Q902F9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113Q902F9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms