Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRTOMTQ8WZ04 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRTOMTQ8WZ04 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms