Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR60Q8WVS4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms