Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKA2Q8WVK7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms