Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF17

SH3TC2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2Q8TF17 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3TC2Q8TF17 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC2Q8TF17 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH3TC2Q8TF17 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3TC2Q8TF17 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms