Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEW8

PARD3B, Partitioning defective 3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD3BQ8TEW8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PARD3BQ8TEW8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PARD3BQ8TEW8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PARD3BQ8TEW8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms