Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELQQ8TDG4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HELQQ8TDG4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELQQ8TDG4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms