Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRSK1Q8TDC3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRSK1Q8TDC3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms