Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71BQ8TC56 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71BQ8TC56 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms