Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC110Q8TBZ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC110Q8TBZ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms