Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNIH3Q8TBE1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNIH3Q8TBE1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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