Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIN3Q8TB24 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIN3Q8TB24 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIN3Q8TB24 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms