Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF397Q8NF99 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms