Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37AQ8NEZ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms