Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C17orf47Q8NEP4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C17orf47Q8NEP4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C17orf47Q8NEP4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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