Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM87AQ8NBN3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms