Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUMF1Q8NBK3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUMF1Q8NBK3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SUMF1Q8NBK3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMF1Q8NBK3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMF1Q8NBK3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMF1Q8NBK3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMF1Q8NBK3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMF1Q8NBK3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMF1Q8NBK3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMF1Q8NBK3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMF1Q8NBK3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMF1Q8NBK3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMF1Q8NBK3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUMF1Q8NBK3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms