Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AVL9Q8NBF6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AVL9Q8NBF6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms