Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD1Q8NB12 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD1Q8NB12 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms