Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAU1

FNDC5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC5Q8NAU1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC5Q8NAU1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC5Q8NAU1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC5Q8NAU1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms