Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ANKRD42Q8N9B4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms