Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM99Q8N816 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM99Q8N816 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms