Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms