Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms