Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFRP1Q8N474 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFRP1Q8N474 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms