Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NME8Q8N427 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME8Q8N427 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NME8Q8N427 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
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