Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBARPQ8N350 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBARPQ8N350 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBARPQ8N350 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBARPQ8N350 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBARPQ8N350 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBARPQ8N350 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBARPQ8N350 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms