Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1V2

CFAP52, Cilia- and flagella-associated protein 52, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP52Q8N1V2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP52Q8N1V2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP52Q8N1V2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP52Q8N1V2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP52Q8N1V2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP52Q8N1V2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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