Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4X1Q8N118 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4X1Q8N118 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYP4X1Q8N118 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms