Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPICE1Q8N0Z3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPICE1Q8N0Z3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPICE1Q8N0Z3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms