Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4BQ8IWT1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4BQ8IWT1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4BQ8IWT1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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